房屋所有權轉移時，維修基金不會自動轉移。《維修資金劃轉協議》簽訂後，受讓人應當攜帶相關材料到專項賬戶管理銀行辦理子賬戶更名手續。根據《民法典》第二百八十壹條的規定，建築物及其附屬設施的維修基金屬於業主。經業主同意，可用於電梯、屋頂、外墻、無障礙設施的局部維修、更新和改造。建築物及其附屬設施維修資金的收取和使用情況應當定期公布。緊急情況下，需要維修建築物及其附屬設施的，業主大會或者業主委員會可以依法申請建築物及其附屬設施維修資金。
法律客觀性:
《民法典》第281條，建築物及其附屬設施的維修資金屬於所有權人。經業主同意，可用於電梯、屋頂、外墻、無障礙設施的局部維修、更新和改造。建築物及其附屬設施維修資金的收取和使用情況應當定期公布。緊急情況下，需要維修建築物及其附屬設施的，業主大會或者業主委員會可以依法申請建築物及其附屬設施維修資金。