債券基金按其投資的債券分類，又可劃分為政府公債基金、公司債券基金、可轉換債券基金、垃圾債券基金等。目前我國的債券基金主要以國債、金融債、企業債和可轉換公司債為具體投資目標券種。
不同債券基金的投資目標並不完全相同，有的基金試圖在維持本金相對穩定的同時給投資者帶來定期的利息收入；有的基金則試圖利用市場變化來獲取投資組合由當期收入和資本利得構成的總回報最大化；還有壹些基金則僅試圖復制某壹固定收益證券市場的大市指數。
根據投資對象都不同，我國目前的債券基金包括純債基金，可以參與壹級市場新股申購的非純債基金、通常投資股票類資產的比例為不超過基金資產凈值的20%如中信雙利債券，壹般這類債券基金收益相對更高些。