根據探究科學網的博客，妳修改了老板申請的自然科學基金後，不能申請其他基金，原因如下:
1.知識產權:如果使用他人的研究成果或申請材料，可能會侵犯他人的知識產權。在學術界和科研領域尊重知識產權是非常重要的。
2.學術道德:未經允許篡改或使用他人申請材料，違反學術道德。學術道德是科學研究的基石，任何違反學術道德的行為都會對學術研究和個人名譽造成嚴重損害。
3.基金項目要求:每個基金項目都有自己具體的申請要求和評審標準。如果直接使用其他項目準備的申請材料，可能達不到目標基金的要求，從而影響申請成功率。