如果國家自然基金項目延期結題，可能會影響項目的資助期限和資金的使用情況。根據國家自然科學基金委員會的規定，項目負責人撰寫結題/成果報告時，不得將待發表或未標註國家自然科學基金資助和項目批準號等的論文列入結題/成果報告；不得直接復制論文內容作為結題/成果報告內容；不得將早於項目資助開始時間的成果列入結題/成果報告。