學院自成立以來，充分利用資源優勢，結合國家和雲南社會經濟發展需求，經過幾代人的不懈努力，在茶樹種質資源、雲南普洱茶、茶葉綜合利用、茶文化等方面取得了重大突破。2006年以來，學院承擔國家、省部級科研項目30余項，研究經費達5000多萬元。其中有國家“十壹五”支撐項目“雲南特色茶產業化關鍵技術研究與示範”；國家基金項目“雲南普洱茶品質形成機理研究”；農業部公益性項目“茶葉清潔加工技術研究及標準制定”；雲南省科技攻關和高新技術發展計劃“雲南普洱茶化學成分及質量標準研究”，雲南省教育廳精品課程建設項目“普洱茶文化學”。特別是國家支持項目的設立，是學院在茶學研究方面進入國家水平的裏程碑，為學院的學科建設和學術水平提升搭建了良好的平臺。
科研成果顯著，在利用有益優勢菌種提高普洱茶品質、研究普洱茶特征成分和質量標準等方面達到領先水平。通過動物實驗，初步證明普洱茶具有降血脂、減肥、抗疲勞、耐缺氧、減緩脂質過氧化、防止非酒精性脂肪肝形成的作用。周教授主編的《雲南普洱茶》2008年出版量達到110000冊，並於2005年出版了韓文和漢文繁體版，對雲南普洱茶的推廣起到了積極的作用。