萬基產業園內企業有23.5%分布在其他金融業、資本市場服務，17.6%分布在房地產業。其中，註冊資本超千萬的企業有深圳國瑞科技投資有限公司、深圳蝌蚪科技應用有限公司、深圳國瑞興業房地產有限公司、深圳國瑞興業發展有限公司、深圳國瑞思創地產開發有限公司等。
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