1.因傷、病住院，按照劃區定點醫療規定，憑少兒住院互助基金醫療證，跨區門診入院須同時提供有效轉診單，出院時少兒住院互助基金支付部分的醫療費用，由醫院記賬結算。凡參加“城鄉居民醫保”者，可報銷的住院醫療費用先按城鄉居民醫保規定結算；互助基金可報銷範圍內居保起付標準以上部分，扣除居保已支付費用和須由本人承擔的互助基金起付標準部分後，余下費用由互助基金支付100%。未參加“城鄉居民醫保”者，可報銷住院醫療費用的50%，在扣除起付標準後，由少兒住院互助基金支付100%。部分病種實行最高限價支付。
2.患“大病”出院後的專科門診治療費用。凡參加“城鄉居民醫保”者，城鄉居民醫保支付後符合互助基金支付範圍的費用，由少兒住院互助基金支付100%；未參加“城鄉居民醫保”者，由少兒住院互助基金支付可報範圍的50%。
3.罕見病：戈謝氏病、法布雷斯病、龐貝病、粘多糖病的特異性藥物費用，由少兒住院互助基金支付可報範圍的50%。
4.少兒住院互助基金設最高支付標準，具體標準可打開隨申辦市民雲，搜索“少兒住院基金”。