1、投保機構交納的保費。這是存款保險基金最主要的來源，投保機構按照規定的費率向存款保險基金交納保費，以獲得存款保險基金的保護。
2、在投保機構清算中分配的財產。當投保機構出現問題需要清算時，其財產的壹部分將會被分配給存款保險基金，以彌補其對存款人的賠償。
3、存款保險基金管理機構運用存款保險基金獲得的收益。存款保險基金管理機構會對存款保險基金進行投資和運作，獲得壹定的收益，這些收益也會增加存款保險基金的規模。
4、其他合法收入。這包括存款保險基金管理機構通過提供服務、發行債券等方式獲得的收入。