基金會中心網總裁程剛介紹，只要基金會在任何渠道披露年度工作報告全文，並且其中項目支出合計占公益支出80%，其分值就可以達到48.8分。但全國卻有1384家基金會分值低於48.8分。“這意味著全國有63%的基金會合規性指標披露不合格，但它們卻都通過了民政部門的年檢。”清華大學廉政與治理研究中心主任程文浩說。
此外，通過民政部門官網、平面媒體等各種渠道，全國仍有20多家基金會除了名稱之外沒有任何其他信息，46家基金會沒有聯系信息。
《基金會管理條例》第二十九條規定：公募基金會每年用於從事章程規定的公益事業支出，不得低於上壹年總收入的70%；非公募基金會每年用於從事章程規定的公益事業支出，不得低於上壹年基金余額的8%。但基金會中心網發現，壹些基金會明顯不符合上述法規。例如，在公募基金會中，湖北省濕地保護基金會連續兩年公益支出比例占上年度總收入的比重不到20%。在非公募基金會中，青島市天泰公益基金會2011年公益支出僅占上壹年末凈資產的1.17%。但它們都通過了年檢。