專項資金的管理原則包括先提取後使用原則、設立專賬原則和專款專用原則。其中,先提取後使用原則是指所有專項資金必須按照規定的來源渠道提取,取得資金後才能安排使用;專賬原則是指每個專項資金都要設立單獨的賬戶進行管理和核算;專款專用原則是指各類專項資金必須按照規定的用途和使用範圍安排支出,其支出不得超過資金規模。同時,應當確保專項資金的使用合理合法。