大額認購
指數基金的大量申購會導致指數基金的跟蹤誤差，大量申購會導致漲幅的稀釋。因為基金交易是當日申購，第二個交易日確認份額，第三個交易日可以查看盈虧。當天的基金大額申購，第二天就享受到了漲幅和收益，但是這只基金還在在途，還沒有確認，所以不計入基金總規模，所以基金管理人不能用這只基金操作。同樣，如果基金在大規模申購的第二天下跌，下跌的幅度也會被稀釋。
大額贖回
大額贖回也會對基金價格產生影響。
根據基金合同規定，超過25%的贖回費應計入基金凈資產。假設某指數基金贖回費率為0.5%，贖回50%的基金份額，如果將25%的贖回費計入基金凈資產，則在不考慮其他因素的情況下，基金凈資產增加0.125%。
贖回基金時，按贖回當日凈值計算價格。贖回後，基金經理需要在第二個交易日賣出部分股份。假設某指數基金贖回50%，第二天指數最高漲5%，最低跌5%，收盤時價格為零。那麽，如果基金經理能在上漲5%的時候賣出，這壹次贖回將使基金凈值增加5%。
暫停股票的影響
假設某指數基金的股票資金停牌20%，該股票的日波動幅度為零。若當日指數上漲5%，則指數基金凈值上漲1%。反之，指數下跌5%，指數基金凈值減少1%。
還有指數基金分紅、成份股倉位調整等等影響指數跟蹤誤差的因素。