輪渡車輛收費方法是總費用=計價重量×（船舶運費 港口作業包幹費 貨物港務費） 。
價格調節基金，裝載貨物車輛長度超過18米或貨物超過車箱長度的車輛，每超1米計費噸增加1噸（不足1米按1米計）。
裝載貨物車輛寬度超過3.1米或裝載貨物寬度超過3.1米，按超寬計費，即過海車輛計費×1.5；對長度超過18米，同時寬度又超過3.1米的車輛按過海車輛計費×2.5。
輪渡的優勢：
輪渡與橋梁、隧道相比，其建設周期短，修建費用低，能較快形成運輸能力。但橋梁、隧道的通過便捷、快速，更有利於提高整個線路的運輸能力。
因此，隨著橋梁與隧道的興建與發展，在大多數情況下輪渡將逐漸被取代。如1957年武漢長江大橋的建成，就結束了客貨、車輛僅能靠輪渡過長江的歷史，並使京漢鐵路與粵漢鐵路連成壹條京廣鐵路。
1968年建成的南京長江大橋取代了輪渡，使京滬鐵路全線貫通；1994年5月建成通車的穿越英吉利海峽的英吉利海底鐵路隧道則取代了英吉利海峽鐵路、公路輪渡，把英國和歐洲大陸連成壹體。