主要審查事業單位是否參照以前年度預算執行情況，根據預算年度收入增減因素，合理確定收入預算，有無故意低報事業、經營等收入，騙取財政、上級補助的情況，或高報上述收入，影響事業計劃完成的問題。
2、預算執行情況。
主要審查事業單位的各項收入是否全部入賬並按規定納入預算管理，統壹使用，有無隱瞞、轉移收入的問題。此外，還要審查事業單位經費使用情況，包括事業單位是否按預算和規定的用途使用經費，有無突破預算、挪用經費的問題等。
3、結余及專用基金管理情況。
結余的形成是否真實合法，有無虛增虛減的問題；各項專用基金的提取是否符合國家規定的標準和來源渠道；專用基金的使用是否符合規定的用途，有無擠占挪用的問題。
4、資產管理情況。
分為無形資產和對外投資。其中，無形資產主要審查其形成和計價是否真實、正確，有無虛增無形資產價值的問題以及無形資產的轉讓是否經過資產評估，評估的程序是否合法，方法是否正確等。而對外投資主要審查其是否合法，是否經過主管部門和財政部門批準或備案；對外投資是否真實，即投出款項是否確實用於預定用途等。
5、往來款項管理情況。
往來款項指事業單位的債權、債務。其主要是審查往來款項是否真實、合法，核算是否正確等。
6、經費使用效益。
以上是事業單位內部審計包括哪些內容的全部解答。