溫和噬菌體在侵染細菌後，可以根據環境不同選擇進入裂解途徑或者溶原途徑。最經典的例子是l噬菌體侵染大腸桿菌，l噬菌體基因組上的pL和pR啟動子決定著其溶原或者裂解的命運。近年來，科學家在枯草芽孢桿菌中發現了壹類新的決定機制：AimR-AimP-AimX決定系統。AimP編碼43個氨基酸的多肽，分泌至細胞外被切割成6個氨基酸的成熟短肽（arbitriumpeptide）；AimR是信號短肽的受體，同時作為轉錄調控因子調控aimX基因的表達；AimX是噬菌體溶原途徑的負調控因子。信號短肽運至細胞內與AimR結合，解除AimR對aimX基因的調控作用，使噬菌體進入溶原周期。這類決定系統廣泛存在於不同類噬菌體中。然而，噬菌體如何識別信號短肽，信號短肽又如何解除AimR與DNA結合的分子機制並不清楚。