法律分析:1，貸款利率不同:商業貸款基準利率為4.9%，5年以上公積金貸款基準利率為3.25%。2.貸款比例不同:同樣壹套房子，如果首套商業貸款可以貸到70%，那麽首套純公積金貸款最高可以貸到80%。3.貸款流程不同:商貸要在過戶前審核，公積金貸款要在過戶後審核。4.審批時間不同:商貸大概20個工作日，公積金貸款大概40個工作日，商貸比公積金貸款快。5.貸款來源不同:商業貸款的來源主要是商業銀行和其他貸款機構籌集的公共資金，而公積金住房貸款是公積金繳存人繳納的資金。6.不同用戶:商業房貸對所有符合條件的社會公眾開放，公積金貸款只對公積金繳存人開放。7.利息的不同用途:商業房貸的利息是商業行為的利潤，屬於相關投資者，而公積金的利息是按政策使用的，只能用於保障房建設。
法律依據:《住房公積金管理條例》第二十六條，繳存住房公積金的職工購買、建造、翻建、大修自有住房，可以向住房公積金管理中心申請住房公積金貸款。住房公積金管理中心應當自受理申請之日起15日內作出是否發放貸款的決定，並通知申請人；準予貸款的，受委托銀行應當辦理貸款手續。住房公積金貸款風險由住房公積金管理中心承擔。