中科大高新校區位於合肥高新區創新大道、何燕子路、石蓮南路、白巖灣路的圍合區域，規劃為校園、人才公寓區、附屬幼兒園、中小學。中國科學技術大學高新校區將力爭2017上半年正式開工建設，比中國科學技術大學五個校區的總面積還要多，將成為中國科學技術大學最大的校區。
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中國科學技術大學高新校區壹期主要建設雙創樓、學科研發樓、圖書情報中心、行政辦公樓、學生公寓、綜合活動中心、體育館、食堂、地下停車庫，總建築面積約42.9萬平方米，其中地上建築面積38.8萬平方米，地下建築面積41，000平方米。
人才公寓區總面積約227畝，建築面積約50平方米。主要是建人才公寓。附屬幼兒園、中小學總占地面積約130畝，建築面積約6萬平方米。主要是建幼兒園、小學、中學的教學樓。
中國科大高新校區正按照“整體規劃、分步實施”的思路推進建設。預計到2025年基本建成，師生總數約2萬人。中科大高新校區2017上半年正式開工建設。高新區將全力打造支撐平臺，打造綜合性國家科學中心核心承載區，做好量子通信國家實驗室核心區和中科大高新校區的規劃設計。