1，住院期間發生的CT檢查費用可按壹定比例從統籌賬戶中報銷；
2.門診CT檢查費可由醫保卡個人賬戶支付；
3.因工傷造成CT檢查的，費用由工傷保險基金報銷；
4.未繳納工傷保險費的用人單位，應當承擔因工傷造成的CT檢查費用。
醫療保險卡使用規定的基本原則:
1，醫保卡必須本人持有和使用；
2.醫保卡可用於結算參保人員的醫療費用；
3.醫保卡的使用應符合當地社會醫療保險的相關政策；
4.醫保卡內資金主要用於支付藥品、診療、檢查費用；
5.醫保卡的使用可能受到每日限額或年度累計支付限額的限制；
6.醫保卡在定點醫療機構有效，跨區域使用可能需要辦理相關手續；
7.醫保卡掛失、補發等服務按照發卡機構規定執行。
綜上，CT檢查的費用可以用醫保卡報銷，住院期間發生的費用可以從統籌賬戶報銷，門診CT檢查的費用可以用個人賬戶支付，因工傷導致的CT檢查費用由工傷保險基金報銷，未繳納工傷保險費的用人單位必須自行承擔費用。
法律依據:
中華人民共和國社會保險法
第二十八條
符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準和急診搶救的醫療費用，按照國家規定由基本醫療保險基金支付。