政府引導基金通過引導創業投資行為，支持初創期科技型中小企業的創業和技術創新。政府引導基金的宗旨是，發揮財政資金杠桿放大效應，增加創業投資資本供給，克服單純通過市場配置創業投資資本的市場失靈問題。特別是通過鼓勵創業投資企業投資於種子期、起步期等創業早期的企業，彌補壹般創業投資企業主要投資於成長期、成熟期和重建企業的不足。引導基金的運作原則是，政府引導、市場運作和科學決策、防範風險。