第壹，贖回機制不同。ETF壹般要求投資者以壹籃子成份股申請實物贖回；LOF與普通開放式基金壹樣，根據基金份額凈值確定對價，采用現金。股票ETF、債券ETF等實物贖回品種贖回即時確認，投資者可在二級市場賣出當日申購獲得的份額；跨境ETF、黃金ETF等全現金替代贖回品種的申購通常在T日確認，T+1日可賣出或贖回。LOF認購於T+1日確認，僅可於T+2日賣出或贖回。
第二，產品透明度不同。ETF通常按照指數的成份股和權重進行投資，倉位接近100%。指數LOF雖然也根據指數進行投資配置，但通常會保持不少於10%的現金，以應對基金贖回。ETF在每日贖回清單中充分披露其投資組合，而LOF只需每季度披露壹次。ETF每15秒提供壹次基金參考凈值，LOF每天披露壹次凈值。
第三，跟蹤指數的效率不同。在實踐中，ETF實物贖回有利於凈值跟蹤指數。比如在牛市中，ETF不會因為新申購資金的不斷湧入而攤薄原有基金收益，也會對凈值跟蹤指數產生影響。