國務院1999年批準設立了科技型中小企業技術創新基金（以下簡稱創新基金）。創新基金自成立以來，深入貫徹落實創新驅動發展戰略，按照加快發展方式轉變和經濟結構調整的總體部署，緊緊圍繞加快培育戰略性新興產業，強化企業技術創新主體地位，以全面提升科技型中小企業技術創新能力為目標，不斷優化技術創新創業環境，充分發揮財政資金的引導作用，引導社會資金和其他創新資源支持科技型中小企業發展，取得了很好的成效。
創新基金由科技部主管、財政部監管，通過無償資助、貸款貼息和資本金投入三種方式，支持科技型中小企業創新創業，已形成了資助種子期、初創期企業的技術創新項目、資助中小企業公***技術服務機構的補助資金項目和引導社會資本投向早期科技型中小企業的創業投資引導基金項目。