1997年獲第四屆吳階平保羅楊森醫藥研究獎三等獎；1999年獲中國藥學發展基金會地奧藥學科技獎三等獎；2002年獲教育部自然科學二等獎，排名第五；2005年獲得教育部提名國家自然科學獎壹等獎，排名第壹；2007年獲得教育部高等學校自然科學壹等獎， 排名第壹。1997年獲得“霍英東教育基金會青年教師基金”；1998年獲得國家教育部“跨世紀優秀人才基金”；1999年獲得“國家傑出青年基金”；2013年獲美國植物協會（ABC）“Farnsworth植物研究傑出成就”獎 。