根據上述職責，省殘聯設6個職能部室： (省政府殘疾人工作協調委員會秘書處、國際交流處)
綜合協調機關政務、事務；負責重要會議的組織安排和議定事項的督查、督辦；負責文秘、機要、檔案、保密、保衛、外事、信息和行政後勤管理工作；負責編輯發行《浙江殘聯》雜誌；負責擬定我省殘疾人事業發展規劃、年度工作計劃；承擔省政府殘疾人工作協調委員會的日常工作；負責開展殘疾人事業國際交流與合作。 編制資金計劃，管理事業經費、國有資產、基建投資、物資配置和機關行政經費；負責直屬單位的財會業務和檢查工作；指導基層殘聯綜合服務設施建設；負責全省殘疾人事業的綜合統計工作；承擔省殘疾人福利基金會的日常工作。