2006年8月，根據盧嘉錫的遺願，盧嘉錫子女們捐出了其生前所獲全部獎金，與農工民主黨中央、中國科學院、廈門大學、福州大學、福建物質結構研究所***同發起創建“盧嘉錫科學教育基金會”。基金會主要用於鼓勵科學創新和支持人才培養，設有“盧嘉錫化學獎”、“盧嘉錫優秀導師獎”和“盧嘉錫優秀研究生獎”，還在廈門設立了“盧嘉錫青少年創新獎”。