另外，衛生實際上包括醫療、衛生、行政，醫院按醫療單位設置科目。疾控、婦幼是按衛生單位專門設置的。醫院會計制度中沒有明確提出“折舊”的概念，但規定了按固定資產賬面價值的壹定比例提取修購基金，用“專用基金和壹般修購基金”核算。
現行制度的會計處理是:提取壹般修理購置費時，借:醫療費和壹般修理購置費；貸款:專項基金和壹般修理及購買基金。在固定資產的核算上，現行制度存在很多問題，據說很快就要改革了。
已繳稅款
1.非營利性醫療機構按照國家規定的價格取得的醫療服務收入，免征各種稅收。
2、非營利性醫療機構從事非醫療服務的收入，如租金收入、財產轉讓收入、培訓收入、對外投資收入等應按規定征收稅款。非營利性醫療機構取得的非醫療服務收入中，直接用於改善醫療衛生服務條件的部分，經稅務機關審核批準後，可在其應納稅所得額中扣除，差額部分征收企業所得稅。
3.非營利性醫療機構生產和使用的制劑免征增值稅。
4.對非營利性醫療機構使用的房產、土地和車船，免征房產稅、城鎮土地使用稅和車船使用稅。
5.個人所得稅需要代扣代繳。
6.各種應稅合同、憑證、權利證書等均應繳納印花稅。