2001年，實際主持的“方證藥動學研究”獲得2001年國家科技進步二等獎，申請人當時所在的第四軍醫大學為壹等獎獲得者，中國中醫科學院西苑醫院為二等獎獲得者。獲獎者有:、、文、任平、蔣永培、馬曉暢等。
“中醫辨證與藥動學的應用”被國家中醫藥管理局選為2001年度國家科技成果推廣項目。
2002年獲得解放軍科技銀星章(申請人本人)；
獲得陜西省“三五人才”二級(陜西省人民政府)。
2003年獲國家傑出青年科學基金(批準號:30325045，國家自然科學基金委員會)。
2006年獲四川省(四川省人民政府)學術帶頭人、四川省中醫藥學術帶頭人。
2011《生物方劑分析藥理研究策略的應用》(第壹完成人)獲湖南省科技進步獎。