個人賬戶是指參保職工個人使用的醫療賬戶基金，主要用於支付門診發生的醫療費用，也可用於沖抵進入統籌支付的部分個人負擔金額，但不得取現、透支或超支。在職職工個人賬戶以個人上年度工資總額為基數，按職工年齡不同比例計入，35歲以下(含35歲)3%，36歲至45歲(含45歲)3.2%，46歲以上3.5%；退休人員按本人上壹年度基本養老金(退休費)的3.8%計入。
用人單位為職工繳納的醫療保險費轉入個人賬戶後，剩余部分為社會統籌醫療基金。統籌基金由醫療保險經辦機構集中管理和使用。主要用於職工住院和可視為住院的門診特殊疾病的醫療費用。