如何確定內部控制缺陷的認定標準如下：
內部控制缺陷包括重大缺陷、重要缺陷和壹般缺陷。
1、重大缺陷：重大缺陷是指嚴重程度已使設備不能繼續安全運行，隨時可能導致發生事故或危及人身安全的缺陷。
2、重要缺陷：重要缺陷是指壹個或多個控制缺陷的組合，可能導致企業嚴重偏離控制目標。
3、壹般缺陷：不構成重大缺陷和重要缺陷的財務報告內部控制缺陷，應認定為壹般缺陷。
內部控制缺陷介紹
內部控制缺陷是指公司內部控制的設計，運行無法合理保證內部控制目標的實現。其中運行缺陷是指設計合理及有效的內部控制，但在運作上沒有被正確地執行。包括不恰當的人員執行，未按設計的方式運行，如頻率不當等。
風險治理重視不夠。現行的內部控制設計主要以事項、流程為基礎，遵循業務的角度，偏重於日常經營治理的遵循，保證制度的遵循性和行為的規範性，主要以監督機制為主。
公司治理結構不合理。內部控制的設計壹般是治理者針對企業的經營過程和企業的狀況而設計的，而由於“經濟人”的特性，企業的經營治理者在內部控制的設計過程中難免會給自己留有壹定的操作空間，以便尋求最大化的利益而忽視了投資者的需求。