能源交通重點建設基金的征收比例為，壹律按照規定的征集範圍，項目的當年收入，按10%的征收率計征。為了更快地加強能源交通重點建設，國務院決定從1983年7月1日起，將征收比例由10%提高到15%。根據國務院國發（198）38號文件規定，凡未開征能源交通重點建設基金的城鄉集體企業和個體工商戶，從1987年5月1日起，按繳納所得稅後利潤的7%征收。國家能源交通重點建設基金的征集工作，由各級稅務部門負責。該項基金采取按月或按季繳納，年終根據有關決算資料，匯算清繳後多退少補的征收方法。