概念：基因分子結構發生改變，即堿基發生變化
結果：產生新的基因，多數情況下是有害的，就如鐮刀型細胞貧血癥（人的血紅蛋白基因堿基序列發生了改變，由CTT突變為CAT），甚至導致生物死亡；少數情況是有利的，導致生物變異，新物種的產生
應用：誘變育種，這是人為利用其有利的壹面
種類：從DNA堿基順序改變來分，突變壹般可分為堿基置換突變、移碼突變、整碼突變及染色體錯誤配對和不等交換4種
染色體變異
概念：染色體數目或者結構發生改變
結果：基因數目或排列順序發生變化，絕大多數情況下是有害的，就如貓叫綜合癥（人的5號染色體上部分基因缺失），甚至導致生物死亡；極少數情況是有利的，導致生物變異，新物種的產生
應用：多倍體育種和單倍體育種，這是人為利用其有利的壹面
種類：通過“折斷——重接”而出現的染色體結構變異可分為缺失，重復，倒位，易位4種。
二者關系為基因位於染色體上。