1、賬戶的資金來源：醫保基金支付的資金主要來源於企業繳納的醫療保險費用以及城鎮居民醫保費用。這些資金用於形成醫保統籌基金，用於在醫保定點醫院的治療報銷。相對而言，個人賬戶的資金則主要來源於職工個人在醫療保險中的繳納金額，這部分資金主要用於支付醫保定點藥店購藥以及醫保統籌基金之外需要由個人支付的醫療費用。
2、使用方式和範圍：醫保基金支付主要用於在醫保定點醫院的治療報銷，其報銷比例會根據就醫醫院的級別有所不同。而個人賬戶的資金則更為靈活，不僅可以在醫保定點藥店購藥消費，還可以在門診治療時使用，沒有使用門檻的限制。此外，個人賬戶的資金還可以用於支付壹些基本醫療保險範圍外的醫療費用，如特殊治療、高端醫療服務等。
3、便捷性、安全性和透明性：醫保基金支付在便捷性上更勝壹籌，因為參保人無需攜帶現金或其他證件，只需出示醫保卡即可在定點醫療機構進行身份核驗和信息登記，然後根據醫療保險政策和標準直接結算醫療費用。同時，由於采用了先進的電子技術和加密手段，醫保基金支付在安全性方面也表現出色，有效保護了參保人的個人信息和賬戶資金。此外，醫保基金支付還能實時記錄和顯示參保人的就醫情況和費用明細，方便參保人隨時查詢和核對，提高了就醫的透明性。