交易費用由中標者支付。按照投標加價4%、3%、2%、0.8%的標準，具體交易中心有收費標準。綜合服務費由代理機構支付。另外還有信息咨詢服務費，壹般不為競價支付。壹般來說，如果中標，需要支付交易費用。如果沒有中標，不需要支付任何費用。
投標保證金提交方式:建設項目應提交的投標保證金由進入中心交易的招標項目中心管理。要求投標人在招標文件規定的時間內將資金足額存入本中心投標保證金專用賬戶，以實際到賬時間為準。投標保證金以銀行轉賬或電匯方式支付，不直接收取現金和個人存折。投標人交納投標保證金時，應在收款憑證上註明招標項目名稱、投標人全稱、聯系人及聯系方式，以備核查。