也就是說，錦鯉會和野生的天然鯉魚雜交。長此以往，自然鯉魚基因會混雜，從而威脅本地鯉魚的純度和生存。家養寵物中，除了錦鯉，還有其他不能隨意飼養的動物，如巴西龜、食蚊魚、清道夫、鱷龜、牛蛙、羅非魚、雀鱔等。
紅鯉會出現在中國各地的鯉群中，可以生活在各種水域。在紅鯉的基礎上，育成的品種有玻璃紅鯉、荷包紅鯉、興國紅鯉、湖北清江紅鯉、浙江甌江彩鯉。
錦鯉是日本人在從中國引進的紅鯉基礎上養殖的，已經成為日本的國魚。以紅鯉為主要養殖對象，壹年四季都有繁殖，春秋兩季產量較高。