舊版《天眼》的最終結局是，沈淵團隊成功揭露了日本特務的陰謀，保護了國家和人民的安全。與此同時，申遠和他的女朋友林婉兒也成功地找到了真兇，為父親的沈默案討回了公道。
新版《天眼》共出版了三冊，分別是《天眼的起源》、《天眼的尋找》和《天眼的終結》。新版的結局還沒有公開，但根據讀者的推測，應該和舊版的結局差不多，就是沈淵和他的團隊圓滿完成了任務，保護了國家和人民的安全。
需要註意的是，由於劇情的復雜和作者的不同安排，不同版本的結局可能略有不同。所以，如果妳想了解更多《天眼》的細節和結局，建議妳購買最新版本或者咨詢官方信息。