清華大學心理學系的歷史非常悠久。最早成立於1926。當年創辦心理學系的唐越先生、孫國華先生、周憲庚先生，都是當時教育界的響當當的人物。
成立之初，心理學系是清華大學理學院最早的六個系之壹。國立西南聯大時期，清華大學心理學系並入聯大文學院哲學與心理學系，改為心理學組，但仍由清華理學院管理。
1952年，清華經歷院系大調整，心理學系與理學院合並到北京大學。與此同時，很多其他文理類專業也轉到了其他院校。
1979，清華大學重新組建教育研究室，成立應用心理學研究室。1987清華大學成立了最早的高校學生心理咨詢中心，為學生提供專業的心理服務。