肝癌早期膽紅素壹般在正常範圍，臨床上沒有黃疸。
少數位於肝門等特殊部位的腫瘤可因膽管受壓而出現梗阻性黃疸。膽紅素逐漸升高，說明病情處於晚期，主要是腫大的癌塊壓迫或肝功能嚴重受損。白細胞/球蛋白倒置是肝功能失代償的重要指標。因為肝癌常合並肝硬化等慢性肝損傷，往往可在早期出現，隨著肝癌體積的增大和肝功能損害的加重更為明顯。血清丙氨酸氨基轉移酶(ALT)或天冬氨酸氨基轉移酶(AST)因肝細胞損傷而釋放到血液中，轉氨酶水平是衡量肝細胞損傷程度的指標。由於肝功能受損，凝血因子生成減少，凝血酶原時間延長，延長至正常值2倍以上時，提示患者不能耐受手術。GGT明顯升高多由巨大腫瘤或門靜脈癌栓形成或活動性肝炎引起，GGT高者預後差。