《收費辦法》確立了司法部門親子鑒定服務的收費標準，屬於政府部門的價格標準。省價格行政主管部門應當制定我省新的收費標準和收費標準。各市、區、州物價局不得超過省標準，並根據具體規定明確當地實際標準。
但《收費辦法》規定，“對社會發展信用度高、鑒定質量高、遵循價格體系的精神病鑒定機構，經企業申請，省級價格行政主管部門批準，可適當提高收費標準。”
2003年5月，我國放寬了社會發展第三方機構DNA親子鑒定中的鑒定業務流程，國家發改委和司法部制定了《司法鑒定收費管理辦法》。親子鑒定屬於法醫物證級別，具體價格由政府部門指導，當地政府根據實際情況核定實際收費標準。所以不同地區的收費標準是有差異的。