壹是根據2009年4月6日國家發布的新醫改方案《關於深化醫藥衛生體制改革的意見》，未來三年的五項重點工作包括加快城鄉基本醫療保障制度建設，初步建立基本藥物制度，完善城鄉基本醫療服務體系，推進基本公共衛生服務均等化和公立醫院改革試點。因此，建立國民健康檔案成為首要任務。
二是實現區域衛生信息化互聯互通和數據共享。目前醫療衛生信息化還處於獨立開發建設的狀態，有可能成為信息孤島。因此，區域衛生信息化必須實現包括婦幼、計生、急救系統在內的互聯互通和數據共享。
三是實現城鄉醫療資源的合理布局。醫療資源分布很不合理，大部分集中在大城市和農村。