(1)辦公室。負責省局機關的文秘、檔案、信訪、機要、保密工作，指導全省質監系統工作；綜合協調省局機關和省質監系統的業務工作；承辦政務公開、政務督查、應急管理、新聞發布、信息化建設和接待工作；負責全省質監系統的政務信息工作。組織省級會議；組織管理全系統的宣傳報道工作；組織協調辦理省人大和省政協的有關議案和提案；管理全省質量監督系統的外事活動；指導省優質新聞工作者協會的工作。
(2)人事勞動部門。負責全系統人事勞動、機構編制、隊伍建設、職稱評審和職業資格認定工作；按照幹部管理權限，承擔全系統領導班子和領導幹部管理工作；組織推進“強檢人才”戰略；制定並組織實施全系統教育培訓計劃；負責出國人事爭議和政審。
(3)政策法規部(基層指導部)。負責質量技術監督政策研究，擬訂質量技術法規和規章建設規劃，起草相關地方性法規和政府規章；負責規範性文件的合法性審核；管理質量技術監督相關技術法規的備案工作；組織實施質量技術監督行政執法監督；負責全省質監系統行政執法人員的培訓、考核和發證管理；負責國家賠償和錯案追究；承辦質量技術監督行政復議和行政訴訟；承擔地理標誌產品保護工作；指導全省質監系統普法工作。承擔質量監督工作的調查研究，提出解決基層存在的普遍性問題的意見和建議；指導基層研究制定運用質監職能服務地方經濟社會發展的政策措施；負責總結推廣基層單位的先進經驗；負責質監系統行政許可審批制度改革。
(4)計劃財務部。制定並組織實施省局和全省質量監督系統的計劃、財務和基建管理制度；編制預決算，下達預算；管理財政、基建項目、資金、國有資產、技術改造、技術裝備等工作。省局機關和全省質量監督系統；負責質量監督的統計工作；負責組織和管理全省質監系統的財務內部審計。
(5)科技司。制定並組織實施全省質量技術監督科技發展規劃、計劃和規章制度；負責制定技術機構和實驗室建設規劃；組織推進科技興檢戰略；組織管理全省質監系統的科研項目、技術引進、新技術推廣、科研成果評價和獎勵；組織制定實驗室儀器設備和科研經費的年度預算和專項計劃，並監督實施。
(6)質量部。組織實施全省質量振興政策措施和政府質量獎勵制度；負責全省宏觀質量管理；組織推進“質量強省、品牌興晉”戰略，建立和實施全省質量信用體系；承辦重大工程設備監管相關事宜；承擔產品防偽的監督管理工作；管理全省工業產品生產許可證；組織協調缺陷產品召回制度的實施；組織質量狀況的統計分析、評價研究和質量學科建設，總結和推廣先進的質量管理經驗和科學的質量管理方法；組織實施國家註冊質量工程師和設備監理師制度；負責農藥登記的預審；指導省質量名牌協會和省金銀珠寶玉石質量協會的工作。
(七)監督管理辦公室(執法監督辦公室)。制定產品質量監督管理制度；承擔國家監督抽查的有關工作，統壹編制並組織實施全省產品質量監督抽查計劃，組織實施全省產品質量監督抽查；負責產品質量安全的強制檢驗和風險監測，制定全省重點監管產品目錄並組織實施；指導纖維質量的監督檢查；管理和協調產品質量的行業監督、地方監督和專業質量監督；組織和管理產品質量的仲裁、檢驗和鑒定；組織實施機動車安全技術檢驗機構設置的規劃、資質管理和監督；監督管理產品質量檢驗機構，依法組織查處產品質量檢驗機構的違法違規行為；指導質檢協會的工作。組織查處違反有關質量技術監督法律法規的行為；組織開展打擊假冒偽劣產品(商品)的違法活動；組織協調全省相關專項打假活動和跨市縣案件的查處工作，對大案要案進行督辦，負責省外移送(移交)案件的查處管理；對各級質量技術監督行政執法機構進行業務指導；組織對重大產品質量事故的調查並提出處理意見。
(8)標準化部門。組織實施標準化法律、法規、規章和國家標準、行業標準、地方標準；組織推進全省標準化戰略；組織和推廣采用國際標準和國外先進標準；負責地方標準的統壹管理、審查、編號和發布；組織協調各部門、各行業的標準化工作；協調和管理省級標準化專業技術委員會；管理企業標準的備案工作；管理組織機構代碼和商品編碼；承擔全省《世界貿易組織技術性貿易壁壘協議》(WTO/TBT)相關標準和技術法規的通報和咨詢工作；指導省級標準化協會的工作。
(9)計量辦公室。組織實施計量法律、法規和規章；負責實施法定計量單位；制定和發布地方計量技術標準和計量檢定規程；組織實施計量器具強制檢定、量值傳遞和比對；監督管理全省計量檢定機構、計量校準機構和社會公正計量機構；組織實施國家註冊計量體系，管理計量檢定人員；負責制造、修理、銷售、進口、使用和檢定計量器具的監督管理；負責管理全省商品量並監督市場計量行為；負責全省能源計量工作；調解計量糾紛，組織計量檢定；負責組織開展節能減排領域的相關工作；指導省計量學會和省計量協會的工作。
(10)認證辦公室。組織實施認證認可法律、法規和規章，制定全省認證認可制度規範，監督管理全省認證認可工作；組織對省內為社會提供證明數據和結果的機動車安全、綜合、環保技術性能檢驗機構、實驗室、產品質量檢驗機構、鑒定機構和檢驗檢測機構的資質認定(計量認證/審批)和監督管理；承擔認證咨詢機構的審核工作；組織對國家強制認證產品的監督管理；負責能效標識管理；推進各類管理體系和產品的自願認證，組織對認證機構和獲證單位的監督檢查，規範認證市場秩序；指導省認證認可協會的工作。
(十壹)食品生產監督管理辦公室。負責全省食品、食品添加劑和食品相關產品的生產許可、質量安全監管和風險監測；負責全省化妝品生產許可和質量監督管理；組織實施生產加工環節不安全食品召回制度；按照規定權限，組織全省食品生產加工質量安全事故的調查處理。
(十二)特種設備安全監管司。綜合管理鍋爐、壓力容器、壓力管道、電梯、起重機械、客運索道、大型遊樂設施、場(廠)內專用機動車輛等特種設備安全監察監察工作；監督檢查特種設備的設計、制造、安裝、改造、維修、使用、檢驗、進出口；按照規定權限組織特種設備事故的調查處理並進行統計分析；監督管理特種設備檢驗檢測機構、檢驗檢測人員和操作人員的資質；監督檢查高能耗特種設備節能標準的執行情況，組織特種設備能耗測試；指導特種設備應急救援隊伍建設；指導省特種設備協會的工作。機關黨委(思想政治工作辦公室)負責機關及直屬單位的黨群工作、黨風廉政建設和文明和諧創建工作。指導全省質監系統思想政治工作和文明和諧創建工作。
退休人員辦公室
負責離退休人員的管理和服務，指導全省質監系統離退休人員的管理和服務工作。
紀檢監察機構執行晉辦發〔2005〕17號文件(5名行政工作人員已移交省紀委統壹管理)。