根據人事制度改革有關文件精神和本單位工作實際，本著理順職能、提高工作效率的原則，新疆環境保護信息中心內設機構設置為:辦公室、網絡綜合管理部和兩個內設科室。
二、崗位設置
新疆環境保護信息中心核定編制6人。目前有員工6人，其中專業技術人員6人。高職院校1崗位，中等職業學校3個崗位，初級崗位2個崗位。
三。環境信息中心的職能
新疆維吾爾自治區環境信息中心(以下簡稱信息中心)是新疆維吾爾自治區環境保護局(以下簡稱自治區環保局)直屬事業單位。信息中心作為自治區環保局的環境信息管理和技術支撐單位，主要任務是發揮全區信息網絡中心、數據通信中心、信息交流中心和技術服務中心的作用。業務工作由自治區環保局辦公室歸口聯系，其主要職責是:
1.貫徹執行國家環境保護環境信息標準和技術規範；承擔國家環保總局衛星通信網(新疆站)的建設、維護和使用；保證我區環境信息網絡與全國環境信息網絡的正常連接和網上信息的安全傳輸。
2 .參與制定全區環境信息工作發展規劃和環境信息管理辦法；組織實施自治區環保局批準的區域環境信息化工作規劃和環境信息系統建設。負責編制和實施新疆環境信息化和計算機應用工作規劃和計劃。
3.負責在全區範圍內建立規範、安全、科學的環境信息采集、傳輸、存儲、處理和應用系統；負責組織全區環境生態信息基礎數據庫的建設和管理；為領導決策和環境管理提供技術支持和咨詢服務。4.承擔全區環保系統信息技術使用和應用軟件開發、信息技術和信息管理人員的培訓，制定環境信息存儲和數據交換方面的各類標準和協議；承擔國家環保總局發布的環境管理應用軟件的研發和軟件的測試及補充功能開發。
5.協助地區局完成“新疆環保局辦公自動化系統”建設，承擔系統完善、維護和人員培訓工作，為自治區環保局辦公自動化及相關衛星加密文件傳輸系統的正常安全運行提供技術支持。
6.承擔新疆環保網的網站建設，主頁的設計、制作、更新和網站管理維護，完成自治區環保局政務信息網上發布；協調相關單位按規定完成省級環境信息的收集、整理、上報和對外發布工作。
7 .協助自治區環保局開展全區環保系統信息隊伍的規範化建設，指導下級環境信息中心的業務工作；審批區域環保系統信息網絡中使用的各類“商品化”或“委托開發”軟件；組織開展全區環境信息技術培訓和技術交流；根據全區環境保護重點工作的要求，在數據庫技術、GIS技術和計算機及網絡通信方面提供特色服務。承擔地理信息系統和遙感技術在環境保護中的應用開發任務，組織開發環境基礎數據庫和環境空間數據庫。
8.負責指導地方環保系統制定和實施計算機軟硬件和網絡配置方案，負責全區環保系統計算機技術培訓任務。
9.承辦省局和國家環保總局信息中心交辦的其他工作。
四、該部門的主要職能
(壹)辦公室的主要職能
1，負責環境信息資源傳輸和發布的審核管理；
2、負責規劃、管理、協調和指導我局系統環境信息網絡的建設和運行；
3.負責中心的行政、文秘、人事、工資、檔案、醫保、社保、財務、稅務、後勤、職工福利、勞動保障和安全等工作；
4、負責起草年度工作計劃、總結、報告和會議工作；
5、負責基建項目、政府采購和固定資產、各類軟件、耗材、勞保、圖書資料的采購、登記和管理；
6.負責中心內部業務協調和監督；
7.負責中心車輛和辦公設備的管理；
8.接受中心安排的其他任務；
(2)網絡管理部分的主要功能
1，負責全區環保系統環境信息網絡技術培訓；
2、負責制定和實施區域環境信息化發展規劃，規劃和實施國家環境信息化標準和技術規範；
3.負責我們的局域網和區域環境信息網絡的技術維護和支持；
4、負責各類應用軟件的正常使用和技術開發工作；
5、負責環境信息網絡病毒防範和網絡安全技術支持；
6、負責環境信息應用技術的研究、開發和推廣；
7.負責辦公自動化軟件平臺的開發、管理、運行、維護和技術支持。
8.負責內外部網站的維護，組織協調內外部網站的信息收集、制作、編輯、審核、發布和管理；
9.負責中心的對外宣傳、廣告策劃與制作，並承擔協作項目；負責網頁制作和維護。
10，接受中心安排的其他工作。