科研項目管理系統(RPMS)將科研項目管理的管理職能分為9個知識領域:綜合管理、範圍管理、時間管理、費用管理、質量管理、人力資源管理、溝通管理、風險管理和采購管理。。
研究項目管理系統(RPMS)側重於科技人員的經驗，通常添加甘特圖來輔助項目進度管理，並結合強大的工作流平臺來實現PMP項目過程的控制和管理。
研究項目管理系統(RPMS)以項目中心為核心管理目標，為項目團隊提供更加規範、科學、精細化的指導和控制；同時結合信息中心和報表中心，為科研單位合理利用資源、應對內外部變化、實現理想目標提供高效、全面、精細的管理思路和方法；RPMS通常是以項目中心為核心，以信息中心和報告中心為輔助管理和分析的管理平臺。
依托PMP項目管理精髓，結合甘特圖和過程平臺，科研項目中心將項目過程管理分為項目啟動、項目計劃、項目執行、項目控制和項目結束五個過程。
同時，充分利用PMP項目管理中的九大知識體系，將其融入到項目管理的管理職能中:進度管理、人力資源管理、成本管理、溝通管理、風險管理、采購管理等。
下面是壹個簡要的流程圖來說明科研項目管理系統中科研項目的管控模式:2.1科研項目中心。
科研項目的規劃與管理
該功能模塊可以規定科研單位產品開發項目規劃管理的工作程序、職責分工和要求，其目的是加強科研單位產品開發項目的規劃水平，提升科研單位產品項目的價值，引導科研單位有效資源的高效利用。
科研項目的規劃與管理流程如下:科研項目的研發管理。
科研項目研發管理是項目管理系統的核心功能，支持從項目立項到項目完成的全過程管理和監控。
科研項目的研發管理對不同角色的用戶進行不同權限級別的控制，主要分為以下角色:項目經理、項目主管、項目經理、項目主管等。
科研項目研發管理的簡單流程如下:科研支持工作管理
對配套項目和配套任務進行分工管理，主要是對各部門的配合和員工的工作進行跟蹤管理。
歷史科研項目探究
管理科研單位過去壹年完成的項目，跟蹤查看過去壹年完成的項目。
科研文獻庫
對R&D項目和支持工作產生的所有文件進行集中和分類管理。方便相關人員查閱和管理相關文件。
相關科研模板
包含各種類型項目的參考文檔、各種類型的工作系統和模板以及壹個倉庫。
2.2科研信息中心
科研單位內部各類數據和信息的集中管理。
包括以下模塊:2.3研究報告中心。
為了提高科研單位的項目管理能力，合理利用資源，應對內外部變化，實現理想目標，基於項目中心的報告中心為科研單位提供高效、全面、細致的管理思路和方法。
報表分析分為三個層次:科研單位報表、部門報表、項目組報表；為科研單位提供不同層次、不同形式的報表分析，為科研單位提供快速準確的分析數據，實現項目的高效化、精細化、全方位、決策化管理。
報告中心的功能結構劃分如下:科研項目管理系統的整體系統結構如下:科研項目管理系統以微軟SQL Server 2005數據存儲為支撐，結合短信發送服務和郵件發送服務，依托強大的工作流管理平臺和甘特圖組件，為項目過程管理提供強大的服務。
3.1數據存儲和其他服務
微軟SQL Server 2005
SQL Server 2005是微軟的下壹代數據管理和分析解決方案，它將為科研單位的應用數據和分析程序帶來更好的安全性、穩定性和可靠性，使它們更容易創建、部署和管理。
研究項目管理系統，通過基於SQL Server 2005的數據存儲，制定相關的數據備份方案和數據維護方案，確保項目管理系統中數據存儲的安全性和穩定性。
短信發送服務
科研項目的相關數據信息能否及時傳達給相關項目人員，在壹定程度上影響著項目實施的進度、項目過程管理的監控效率和最終的項目結果。
研究項目管理系統在整個項目管理過程中提供相關短信提醒服務，為項目相關人員提供及時高效的信息服務，保證項目實施的高效率。
郵件遞送服務
郵件發送服務貫穿於科研項目管理系統，為用戶提供及時有效的待辦事項，提高相關人員的工作效率。
3.2中間件
工作流管理平臺
工作流管理平臺為科研項目管理中各個領域的管理提供流程標準化和流轉服務；用戶只需定義相關流程所需的角色和表單數據，即可支持和控制項目流程管理，提高項目實施和管理的效率。
甘特圖組件
在科研項目管理過程中，進度管理是項目管理和控制的核心。為了對各類項目進行標準化、程序化和管理，項目管理系統輔以甘特圖組件，其強大的甘特圖管理功能和工作流管理平臺的相關功能形成了獨特的、標準化、程序化、易於監控的進度管理功能，為項目的標準化管理提供了有力的支持。
3.3網絡管理平臺
WEB管理平臺，即項目管理系統用戶使用的平臺；項目管理體系由項目中心、信息中心和報告中心組成，將項目管理的管理職能分為集成管理、範圍管理、時間管理、費用管理、質量管理、人力資源管理、溝通管理、風險管理和采購管理9個知識領域。。4.1功能指示器
科研項目管理系統采用先進的工作流管理平臺作為項目過程管理和控制的支撐平臺，結合甘特圖的進度控制，為項目計劃和精細化管理提供有力支持，更直接、更全面地支持項目各個過程和領域的管理。
報告中心以直觀、豐富的報告為科研單位各級人員合理利用資源、應對內外部變化提供準確的數據依據。
4.2績效指標
研究項目管理系統支持200個同時在線用戶。
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4.3兼容性指示器
科研項目管理系統平臺基於B/S架構，支持用戶在IE6.0、IE7.0、IE8.0等內核版本的瀏覽器下進行相關操作。