它是學校的綜合管理機構。負責文秘工作、宣傳、信息調研、綜合統計、行政管理、外事、接待、檔案管理和學校網站管理。校辦主要負責學校工作計劃、總結、報告等綜合性文件的起草及學校其他部門起草文件的審核，編輯《利州中專大事記》；負責起草教工會議、政治學習、總支部會議、行政會議、校務委員會會議的安排、記錄和紀要；負責行政公文的收發、登記、審核、核對、傳遞、歸檔、保管和利用；負責督促校務委員會會議決定的事項；承辦校外客人的接待工作；負責外事管理；負責學校交通車輛的管理；完成學校領導交辦的其他任務。
教學事務科
是學校的教學管理部門，教學管理上隸屬於醫藥衛生教學部、機電教學部、電子信息教學部。主要負責學校教學計劃管理、教學運行管理、教學質量管理和評價，以及專業設置、科研、課程、教材、實踐教學基地、學風、師資隊伍、教學管理制度、教師繼續教育培訓等教學基礎設施的管理。負責實驗室、實訓室和學生在校實習的管理，貫徹國家關於實驗室、實訓室工作的方針、政策、法律、法規，結合學校實際情況制定相應的規章制度並組織實施。
學生區
依據法律法規和學校規章制度對學生實施綜合管理。負責制定全校思想政治教育計劃和各項管理制度並組織實施；負責學生的日常教育和管理；負責學生宿舍的管理；負責各類優秀學生的評選和表彰；負責學生社團工作和大型學生活動的組織管理；負責各類學生助學金的發放；負責對違紀學生的調查、研究和處理；負責學生的心理健康教育。學校學生管理部和學校團委合署辦公。
總務科
是學校提供後勤服務和保障的職能部門，承擔著服務教學、師生和學校科學發展的重任。在校長和主管副校長的領導下，履行下列職責:
1.強化服務意識，將管理融入服務。認真貫徹落實學校《關於加強行政後勤效能建設的暫行規定》，切實轉變工作作風，提高工作質量和效率。按照“熱情服務、精細管理、節儉精算、誠信高效、團結協作、大力支持”的目標管理總體要求，積極開展各項工作，不斷加強後勤隊伍和保障能力建設，主動適應學校發展需要。
2.負責學校食堂和服務部的管理和監督，確保食品安全，提高食品質量，改善服務態度，不斷提高師生滿意率；做好壹卡通系統的管理和服務工作，定期盤點，確保賬卡相符。
3.負責水電、五金鐵件、木工、玻璃、油漆等項目的日常維護及相關管理；保證水電正常供應，及時堵漏，防止人為浪費，做好節能減排工作；規範倉庫管理，確保帳卡相符。
4.負責學校醫務室的管理，做好師生醫療保健和重大傳染病預防的宣傳工作，定期對校園進行消毒，紮實做好除四害工作。
5.對校園建設提出意見和建議。負責學校基建及改造項目的編制、審批、預(決)算程序及招投標相關事務；負責召集項目質量管理小組和專業監理小組做好項目質量管理和監督工作，嚴格遵守相關項目質量管理制度，認真控制項目質量、工期、投資規模和完整性。
6.配合學校住房分配領導小組提出教職工住房分配方案。
7 .負責校園綠化美化的規劃、實施和管理，不斷提高校園綠化美化水平；建立“綠色”檔案，宣傳“綠色”文化，不斷提高“省級綠色紅旗單位”建設水平，積極創建“省級園林單位”。
8 .負責學校家具、辦公用品、勞保用品、清潔用品等物品的采購計劃的編制和發放；完善手續，定期盤點，確保賬物相符。
9.認真落實《關於實行衛生責任承包進壹步做好學校衛生工作的意見》，負責總務部分管的衛生工作，落實衛生工作責任制。
10.負責學校零星物品的采購，參與學校大宗物品的集體采購和驗收；做好寒暑假師生返鄉車票的購買和發放工作。
11.建立壹個安全部門。認真履行《校園安全責任狀》規定的職責，負責總務部門的安全工作，認真落實《總務部門安全工作責任制》。熱情接待師生來訪，做好解疑釋惑、化解矛盾、維護穩定工作。
12.建立壹個學習部門。加強幹部職工隊伍建設，堅持學習理論和業務知識，不斷提高後勤服務能力和水平。
13.建設廉潔部門。認真履行《黨風廉政建設責任書》規定，做好校務公開和支部事務公開，落實“壹崗雙責”，嚴禁違規收費，嚴禁設立“小金庫”，抓好反腐倡廉工作。
14.建設節約型部門。堅持勤儉節約，反對鋪張浪費，精打細算，做好每壹筆支出預算。
15.負責建立健全基建和改造工程管理檔案，完善學校安全工程檔案；完善總務等管理檔案。
16.完成學校領導交辦的其他任務。
教育科學實驗室
是廣大教職工為學校校長領導教育教學改革，在教育科研中做出正確決策提供科學依據。是信息部門為學校領導和教師提供教育信息，宣傳學習教育理論；它是指導學校各級教學改革和教育研究的總部；除全面負責學校教育科研日常工作外，主要承擔應用型、發展型教育科研課題研究。在教育科研管理體系中，學校教學部是基層管理單位，直接面對教育對象和教育實踐。教育科研成果的研究和推廣既是探索者，也是受益者，學校教學部是開展教育科研的重要基礎部分。
學校的教學部是學校內部的中層機構。其主任、副主任應由上級教育行政主管部門任命，專兼職教研人員由校長直接選派、安排或任命。學校教學部與學校的教導處、政教處、總務處等常設中層機構並列，直接向校長負責，完成學校教育科研相關工作。
教學部門和學校教導處之間既有聯系又有區別，在教學業務上相互支持，密切配合，使教學和科研工作正確無誤。教導處以教務管理為主，指導教學研究，評價師生教學績效；教學部重點提高教師的理論水平和科研素質，組織管理學校科研項目，完成科研任務。同時，教學部門的專職和兼職教研員對學校的教學改革和科學研究起著關鍵作用。