采用三層架構模式實現LIMS，系統的界面層和業務層相互分離，無論界面層還是業務層的變化都不會相互影響。因此，盛遠光認為有利於系統的維護和功能擴展，增強了系統的靈活性。業務邏輯是在應用服務器上實現的，而不是在每個客戶機上。同時，對數據的訪問只能通過應用服務器來完成，從而增強了系統的安全性。