1，開發團隊不同:優麒麟是中國Canonical公司和中國工業和信息化部軟件與集成電路促進中心聯合開發的操作系統，是中文版Ubuntu的定制版，而銀河麒麟是中國國防科技大學、中軟、聯想、浪潮集團、國星公司聯合開發的操作系統。
2.應用對象不同:友麒麟主要為個人用戶和家庭用戶提供豐富的應用軟件和良好的用戶體驗，而銀河麒麟主要為政府、金融、電信等對信息安全要求較高的機構和企業提供更安全可靠的操作系統。