1.學校類型不同:藍谷小學是市屬公辦小學，藍谷實驗小學是區屬公辦實驗小學。
2.辦學特色不同:藍谷小學註重素質教育，強調學生的全面發展，培養學生的良好習慣和道德修養；藍谷實驗小學強調素質教育的創新，推行“探究式學習”模式，註重學生創新能力的培養。
3.教學方式不同:藍谷小學實行單班單班制，每個班都有固定的老師；藍谷實驗小學采用“1+X”的課程模式，其中“1”為核心課程，“X”為選修課程，使學生選課更加自主。