中國電子科學研究院是中國電子工業的重要研究機構，具有豐富的科研經驗和技術實力。該院在電子科學、通信技術、信息安全等領域擁有突出的研究成果和專業人才。同時，中國電子科學研究院與國內外多所高校和企業合作，形成了良好的科研合作網絡。相比之下，航天九院在航天技術領域有壹定優勢，但在電子科學和通信技術方面的研究實力相對較弱。所以綜合考慮，中國電子科學研究院更好。