種黑木耳的時候，用樺樹芯比較合適。由於樺樹芯是樺樹的中心部分，其纖維較短，密度較低，含有較多的木質纖維素和半纖維素，木質素含量較少，更容易被黑木耳利用。
相比之下，樺樹皮密度較大，纖維較長，木質素含量較高，脂肪、蛋白質等營養成分較多，不利於黑木耳的生長發育。