中國國際緊急醫療隊(四川)由國家衛生委和四川省衛生健康委共同管理和運作。國家衛生委員會作為國家衛生管理機構，負責制定和實施相關政策和規劃，指導各地衛生工作。四川省衛生健康委員會作為地方衛生管理機構，負責國家衛生健康政策和規劃的具體實施，包括應急醫療隊的管理和運行維護。