在各級政府的關心和資助下，由原來的沈陽檢察院改制為中國醫科大學附屬口腔醫院。5月27日1987，醫院成立慶典。
口腔醫院成立後，發現口腔頜面外科病房遇到了很多難以克服的困難。1994經過學校、附壹院、口腔醫院領導多次協商，決定將口腔外科搬到附壹院。
從65438到0997，醫院領導班子開始籌劃新樓的籌建。2000年4月，衛生部批準了該建築。2002年4月破土動工，2003年8月竣工並投入試運行。建成後，口腔醫院綜合樓占地12000平方米。2004年9月，在現任領導的努力下，分開十年的口腔頜面外科和整形外科順利回歸醫院。2004年9月17日，中國醫科大學口腔醫學院新樓落成典禮舉行。時任省委書記、省人大主任的聞世震為醫院題詞:“在精誠團結的這壹年，我們將爭創壹所高道德、高技術的壹流口腔醫院。”
新樓的落成和口腔頜面外科、整形外科的回歸，成為口腔醫學院發展新的裏程碑。醫院自建院以來，壹直承擔著沈陽、遼寧乃至東北三省的口腔疾病診治，以及遼寧省老幹部的口腔保健工作。2005年，認證醫院口腔頜面外科成為全國七大專科培訓基地之壹。沈陽市醫學會口腔醫學分會成立於2006年2月(12)，隸屬於該院。
每個部門每年開展6-10項新技術。顳下頜關節內窺鏡、等離子手術、精密鑄造修復技術、各種固定正畸技術和舌側正畸技術、根管顯微鏡和鎳鈦根管預備系統、全身麻醉下兒童牙病的治療、超聲波骨刀的應用等的發展，使醫院的醫療技術水平邁上了壹個新的臺階。2005年，承辦中華慈善總會“微笑直通車”項目，至今已為470多名患者提供免費治療，為構建和諧社會做出了應有的貢獻。近兩年，中國醫科大學附屬口腔醫院連續被遼寧省衛生廳評為“誠信服務先進單位”。
中國醫科大學開展口腔醫學教育較早，培養了大批口腔醫學專門人才。建國初期培養了80多名口腔醫學專業的學生。1978成立五年制本科口腔醫學專業，正式招生。1985年5月，經衛生部批準成立口腔醫學系。65438-0998在中國醫科大學黨政領導的大力支持下，成立了口腔醫學院。中國醫科大學口腔醫學院經過十余年的發展，擁有口腔基礎醫學和口腔臨床醫學兩個學科和兩個二級學科碩士學位授權點的口腔臨床醫學博士學位授予權，並獲得了口腔醫學碩士專業學位試點單位資格。博士生導師9人，碩士生導師34人。