土地財政的根源是否在於分稅制，壹直遭遇業內人士的激辯。
有人認為，1994年的分稅制改革後，財權過分集中在中央政府，地方的財權和事權不對稱，地方不得不另辟財源，土地財政應運而生。這個分析看上去有道理，但並不準確，地方財政赤字的主要原因是支出增長過快，特別是金融危機期間，執行拉動內需的政策，各地無不大幹快上，地鐵、公路、機場等基礎設施投資猛增。支出超過收入，地方政府只好用賣地收入和土地抵押貸款彌補不足。
用土地作為抵押，獲得銀行貸款，這是土地財政的重要組成部分。地價不僅影響賣地收入，而且在很大程度上決定了地方政府債務融資的規模。官方數字表明，截至去年年底，全國***有各類地方政府融資平臺8000多個，貸款余額8萬多億，相當於中央和地方政府壹年的財政預算總收入。
“土地改革的核心矛盾在於征地改革，征地制度難以破除的原因在於地方政府對土地財政的依賴。”在不少代表看來，所謂土地財政依賴癥，即是指地方賣地收入占到了地方可支配財政收入的壹半以上，甚至更多。很不幸，全國絕大部分城市都患上了土地財政依賴癥。
雖然兩會上，各個界別的委員和代表們對於這個事情都痛心疾首，表示必須改馬上改。而作為當政者來說，或許才真正能體會個中滋味。但是地方政府卻不能這麽做，因為土地是國有資產，土地價格最起碼要地市壹級政府才有決定權。於是，每次只能在明明沒有市場的情況下，仍然要去賣地，地賣不出去，再上報，再等降價。等地方政府反映完了，市場可能已經出現了變化。
對於分稅制改革，天津財經大學財政學科首席教授李煒光屢有呼籲。早在2009年12月31日，李煒光教授就曾表示：我們說的土地財政它造成了今天這個局面，就是說地方政府要追求GDP、要追求地方的財政收入。