1、孫家鼐
孫家鼐（1827~1909），字燮臣，號蟄生、容卿、淡靜老人，安徽壽州（今淮南壽縣）人。清鹹豐九年（1859）狀元，與翁同龢同為光緒帝師。
累遷內閣學士，歷任工部侍郎，署工部，禮部、戶部、吏部、刑部尚書。1898年7月3日以吏部尚書、協辦大學士受命為京師大學堂（今北京大學）首任管理學務大臣，1900年後任文淵閣大學士、學務大臣等。卒後謚曰“文正”。
2、嚴復——校長任期（1912.02-1912.10）
嚴復（1854年1月8日—1921年10月27日），男，原名宗光，字又陵，後改名復，字幾道，漢族，福建侯官縣人，近代極具影響力的資產階級啟蒙思想家，著名的翻譯家、教育家 。
新法家代表人物。先後畢業於福建船政學堂和英國皇家海軍學院，曾擔任過京師大學堂譯局總辦、上海復旦公學校長、安慶高等師範學堂校長，清朝學部名辭館總編輯。
3、蔡元培——校長任期（1916.12-1927.08）
蔡元培（1868年1月11日－1940年3月5日），字鶴卿，又字仲申、民友、孑民，乳名阿培，並曾化名蔡振、周子余，漢族，浙江紹興府山陰縣（今浙江紹興）人，祖籍浙江諸暨。教育家、革命家、政治家。民主進步人士，國民黨中央執委、國民政府委員兼監察院院長。中華民國首任教育總長。
4、胡適——校長任期（1945.09-1948.12）
胡適（1891年12月17日～1962年2月24日），男，曾用名嗣梗，字希疆，學名洪駁，後改名適，字適之。 思想家、文學家、哲學家。徽州績溪人，以倡導“白話文”、領導新文化運動聞名於世。
幼年就讀於家鄉私塾，19歲考取庚子賠款官費生，留學美國，師從哲學家約翰·杜威，1917年夏回國，受聘為北京大學教授。
5、馬寅初——校長任期（1951.06-1960.03）
馬寅初（1882年6月24日—1982年5月10日），字元善，中國當代經濟學家、教育學家、人口學家。浙江嵊州人。馬寅初自幼聰穎，刻苦攻讀，曾留學美國，獲博士學位。學成回國後，拒絕軍閥、政客拉攏，毅然到北京大學任經濟學教授，致力於教學與科研。
著書立說，抨擊時弊，成為“五四運動”前夕就享譽很高的教授。 曾擔任南京政府立法委員，新中國建立後曾歷任中央財經委員會副主任、華東軍政委員會副主任、重慶大學商學院院長兼教授、南京大學教授、北京交通大學教授、北京大學校長、浙江大學校長等職。